Maar de Cortez was slechts de eerste in een hele reeks roemruchte uitvindingen van Bowerman. In totaal schreef hij acht patenten op zijn naam, waaronder schoenen met een externe hakversteviger, een verbeterde plaatsing van spikes en een dempende spikeplaat. Ook bleef hij continu streven naar het design van de lichtst mogelijke hardloopschoen, en dit was slechts zijn eerste succes op die weg.
"Hij dacht dat hardloopschoenen wel beter konden". Dit zei Jeff Johnson, Nike's eerste fulltime medewerker, over Bowermans eerste innovaties. "Gevestigde ideeën over grip, demping, biomechanica en zelfs lichaamsbouw werden door hem aan de kaak gesteld.''
Daarna ging Bowerman aan de slag om een schoen te creëren die zonder metalen spikes toch zorgde voor een heel goede grip op veelsoortige ondergronden. De doorbraak in die zoektocht kwam in 1970, toen hij tijdens het ontbijt bestudeerde hoe de siroop op zijn wafel in een patroon van holtes werd vastgehouden. Hij vroeg zich af: "Wat als je dit patroon nu zou omkeren en een materiaal zou maken met een wafelpatroon?" Vervolgens claimde hij het wafelijzer van het gezin en verwisselde het wafelbeslag voor gesmolten polyurethaan. Helaas vergat Bowerman om het ijzer eerst in te smeren met een anti-aanbakmiddel, waardoor het compleet dichtkleefde. Maar hij liet zich door de tegenslag niet uit het veld slaan en fabriceerde uiteindelijk een licht, flexibel, veerkrachtig soort rubber dat in de vorm van een verhoogd rasterpatroon zorgt voor grip.
Bij Blue Ribbon Sports zetten ze alles op alles om de wafelpatroonzool klaar te stomen voor de olympische kwalificatiewedstrijden atletiek van 1972 in Eugene (Oregon, VS). Ze gebruikten nylon bovenwerk uit Japan, maar de vellen rubber met wafelpatroon, waaruit met de hand zolen werden gesneden, kwamen uit Eugene. Een van de eerste medewerkers van Blue Ribbon Sports lijmde de componenten aan elkaar en maakte schoenen voor een handvol wedstrijdhardlopers om ermee te trainen of om ze uit te testen in het atletiekstadion van Eugene, Hayward Field.
Deze handgemaakte schoen kreeg de bijnaam Moon Shoe (maanschoen), vanwege de opvallende voetafdruk. Deze deed denken aan de voetafdrukken die Amerikaanse astronauten van de Apollo-missies op de maan achterlieten. De eerste versies van de schoen waren nog wat primitief, maar hardlopers waardeerden het loopgevoel en de grip van de zolen met wafelpatroon, en de nieuwe uitvinding kreeg snel meer bekendheid. Bowerman verfijnde zijn concept en ontwikkelde in 1974 de iconische Waffle Trainer.